Los datos del estudio muestran una fuerte correlación negativa entre la abundancia de los Firmicutes y las poblaciones bacterianas patógenas en los intestinos. Estas diferencias fueron exageradas en los animales aislados. Varias técnicas, entre ellas la PCR, mostró respuestas significativas de genes específicos del intestino relacionadas con el ambiente inicial. De forma significativa, los cerdos indoor mostraron un aumento en la expresión del gen del interferón tipo 1, el Complejo Mayor de Histocompatibilidad clase I y varias quimioquinas.
Estos resultados indican que el ambiente durante el cual transcurren los primeros periodos de vida afecta de forma significativa tanto sobre la composición de la microbiota intestinal durante las fases posteriores como sobre la función inmune innata de la mucosa. Se observó como la microbiota dominada por los lactobacilos puede mantener la homeostasis inmune de la mucosa y limitar la colonización por patógenos.
IE Mulder, B Schmidt, CR Stokes, M Lewis, M Bailey, RI Aminov, JI Prosser, BP Gill, JR Pluske, C-D Mayer, C Musk and D Nelly. Environmentally-acquired bacteria influence microbial diversity and natural innate immune responses at gut surfaces. BMC Biology. 7:79doi:10.1186/1741-7007-7-79.